物流成本的界定模糊。美国将物流成本分为库存费用、运输成本和物流管理费用。现代物流与传统物流费用计算的最大区别，它把降低物流成本与加速资金周转统一起来；运输成本包括公路运输、其他运输费用和货主费用。公路运输包括城市内运输与区域间卡车运输，其他运输方式包括铁路运输、国际国内运输、油气管道运输等，货主费用包括运输部门运作及装卸费用；而另外一部分物流管理费用在美国是按照历史情况由专家确定一个固定比例，乘以库存费用和运输费用的总和得出来的。

设备落后导致效率低下。目前我国的大部分物流企业都是由传统体制下的仓储业，运输业发展而来，在设备更新下缺乏资金，无论是硬件的购买还是软件的开发应用都难以施行，以至设备落后，机械化水平低，计算机应有很有限，仓储管理自动化程度低，从而造成效率低下。　　

成本支出大，浪费严重。据统计，我国物流成本占GDP的20%，而发达国家物流成本占GDP的10%左右，一些实力强大的跨国公司，如沃尔玛、麦当劳，其物流配送的成本只有其商品销售价格的5%左右。减少浪费，节约成本，是提高物流企业竞争力的重要途径。　　

竞争混乱，社会资源浪费严重。我国既有发展迅速，经济实力相对较高的大企业，也有一些小规模的下游企业，这就造成社会竞争主体的混乱多样。多样的主体使社会难以形成物流网络及普遍的企业联盟。我国的资源有限，混乱的主体间过度竞争严重浪费社会资源，成为制约我国物流发展的一个主要瓶颈。